Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD5Q9P267 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD5Q9P267 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms