Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPMQ9NSP4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms