Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLMPQ9H6B4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms