Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHACTR1Q9C0D0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms