Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SALL3Q9BXA9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms