Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFT27Q9BW83 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms