Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM71F1Q96KD3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FAM71F1Q96KD3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms