Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5RAP3Q96JB5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms