Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C18orf8Q96DM3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms