Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms