Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC112Q8NEF3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms