Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms