Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGD3Q5JSP0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms