Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL12Q53G59 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms