Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CARTPTQ16568 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms