Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX1Q15699 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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