Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms