Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC3Q15034 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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