Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NBR1Q14596 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NBR1Q14596 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NBR1Q14596 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NBR1Q14596 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms