Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.467e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-211ENST00000482605 626 ntTSL 212.04□□□□□ -0.487e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.577e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GLIPR2-204ENST00000474050 2702 ntTSL 211.38□□□□□ -0.597e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.67e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KLC1-223ENST00000557172 540 ntTSL 411.3□□□□□ -0.67e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-203ENST00000413916 3773 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-213ENST00000461886 624 ntTSL 210.96□□□□□ -0.657e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-205ENST00000463863 565 ntTSL 210.86□□□□□ -0.677e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-211ENST00000637271 5335 ntTSL 510.76□□□□□ -0.697e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-216ENST00000557079 722 ntTSL 310.54□□□□□ -0.727e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GCDH-215ENST00000591050 423 ntTSL 310.45□□□□□ -0.747e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LINC00623-203ENST00000615424 590 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.777e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.87e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.847e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-214ENST00000555660 333 ntTSL 39.61□□□□□ -0.877e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 IK-208ENST00000515015 493 ntTSL 29.59□□□□□ -0.877e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MPRIP-211ENST00000578209 751 ntTSL 39.58□□□□□ -0.887e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 FAH-207ENST00000558627 842 ntTSL 59.45□□□□□ -0.97e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRAMD1A-210ENST00000599476 599 ntTSL 29.44□□□□□ -0.97e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.917e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.017e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-205ENST00000586370 911 ntTSL 28.72□□□□□ -1.017e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-204ENST00000462221 817 ntTSL 58.61□□□□□ -1.037e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AL034397.3-201ENST00000618234 1690 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.057e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 COMMD1-205ENST00000455659 388 ntTSL 38.4□□□□□ -1.067e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TOP3A-207ENST00000493648 503 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.077e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-216ENST00000494558 710 ntTSL 58.27□□□□□ -1.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WAPL-203ENST00000372075 1799 ntTSL 28.21□□□□□ -1.17e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.127e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.157e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-212ENST00000482093 725 ntTSL 57.81□□□□□ -1.167e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.197e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WAPL-204ENST00000484070 3207 ntTSL 27.61□□□□□ -1.197e-6■■□□□ 14.2
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PABPC4Q13310 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.347e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.367e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CRLF3-206ENST00000585268 522 ntTSL 46.22□□□□□ -1.417e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CRLF3-204ENST00000583527 378 ntTSL 56.12□□□□□ -1.437e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.57e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KLHL23-204ENST00000448589 594 ntTSL 25.26□□□□□ -1.577e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-215ENST00000490505 568 ntTSL 54.34□□□□□ -1.717e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-207ENST00000469331 553 ntTSL 23.9□□□□□ -1.797e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.837e-6■■□□□ 14.2
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PABPC4Q13310 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 58.59□□□□□ -1.031e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 14.2
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PABPC4Q13310 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SSR3-201ENST00000265044 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.973e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KMT2B-202ENST00000585476 2864 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.233e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.979e-9■■□□□ 14.2
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PABPC4Q13310 SERPINB1-203ENST00000468511 449 ntTSL 37.73□□□□□ -1.175e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.451e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.11e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-226ENST00000552461 2591 ntTSL 217.83■□□□□ 0.441e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-205ENST00000546989 993 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.141e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-214ENST00000549098 1106 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-203ENST00000392514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPLP0-202ENST00000313104 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-23■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TMED3-205ENST00000558562 938 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 213.19□□□□□ -0.39e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 NDUFAF8-205ENST00000576002 365 ntTSL 218.79■□□□□ 0.69e-13■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 NDUFAF8-203ENST00000573173 709 ntTSL 215.68■□□□□ 0.19e-13■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.545e-27■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.177e-36■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UBE2B-206ENST00000507277 644 ntTSL 511.18□□□□□ -0.629e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.524e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 222.05■■□□□ 1.124e-9■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.631e-36■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.019e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CDK2AP2-202ENST00000525402 1692 ntTSL 221.19■□□□□ 0.989e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.321e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-204ENST00000367572 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PTTG1-203ENST00000517480 684 ntTSL 59.66□□□□□ -0.864e-11■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-8■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PTTG1-207ENST00000524244 434 ntTSL 28.48□□□□□ -1.054e-11■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TPI1-208ENST00000495834 820 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TPI1-203ENST00000462761 374 ntTSL 312.76□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.632e-31■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-31■■□□□ 14.2
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