Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFT88Q13099 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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