Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSRP1Q08945 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms