Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME1Q06323 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME1Q06323 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms