Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC18A2Q05940 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A2Q05940 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms