Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms