Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIBQ01892 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms