Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA3P59666 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA3P59666 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA3P59666 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA3P59666 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms