Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA1P59665 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA1P59665 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA1P59665 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA1P59665 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA1P59665 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms