Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIRAP54198 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIRAP54198 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms