Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCT3P49368 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCT3P49368 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms