Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FNTBP49356 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FNTBP49356 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FNTBP49356 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FNTBP49356 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FNTBP49356 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms