Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDIT3P35638 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms