Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms