Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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