Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms