Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms