Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TVP23AA6NH52 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms