Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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