Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms