Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms