Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms