Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOL4Q9BPW4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOL4Q9BPW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms