Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRAC1Q96KF2 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms