Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCMH1Q96GD3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms