Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC38A9Q8NBW4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms