Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKAP1Q86WV1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms