Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms