Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDB1Q16531 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDB1Q16531 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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