Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX1Q15699 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms