Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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